חדר נקי בית חולים משמש בעיקר בחדרי ניתוח מודולריים, נמרץ, חדר בידוד וכו'. חדר נקי רפואי הוא תעשייה ענקית ומיוחדת, במיוחד לחדר ניתוח מודולרי יש דרישה גבוהה לניקיון האוויר.חדר ניתוח מודולרי הוא החלק החשוב ביותר בבית החולים והוא מורכב מחדר ניתוח ראשי ואזור עזר.רמת הניקיון האידיאלית ליד שולחן הפעולה היא להגיע לדרגה 100. בדרך כלל ממליץ על תקרה של זרימה למינרית מסוננת באמצעות Hepa לפחות 3*3 מ' בחלק העליון, כך ששולחן הפעולה והמפעיל יכולים להיות מכוסים בפנים.שיעור ההדבקה של המטופל בסביבה סטרילית יכול להפחית יותר מפי 10, כך שהוא יכול פחות או לא להשתמש באנטיביוטיקה כדי למנוע פגיעה במערכת החיסון האנושית.
קח לדוגמא את אחד מהחדרים הנקיים בבית החולים שלנו.(פיליפינים, 500 מ"ר, כיתה 100+10000)
