חדר נקי פרמצבטי משמש בעיקר במשחה, מוצק, סירופ, ערכת עירוי וכו'. תקן GMP ו-ISO 14644 נחשבים בדרך כלל בתחום זה. המטרה היא לבנות סביבת ייצור סטרילית מדעית וקפדנית, מערכת תהליכים, תפעול וניהול ולחסל באופן קיצוני כל פעילות ביולוגית אפשרית ופוטנציאלית, חלקיקי אבק וזיהום צולב על מנת לייצר מוצר תרופתי איכותי והיגייני. צריך לבחון את סביבת הייצור ואת נקודת המפתח של בקרה סביבתית לעומק. צריך להשתמש בטכנולוגיה חדשה לחיסכון באנרגיה כאופציה מועדפת. כאשר הוא סוף סוף מאומת ומוסמך, חייב להיות מאושר על ידי מינהל המזון והתרופות המקומי תחילה לפני כניסתו לייצור.
קח לדוגמא את אחד מהחדרים הנקיים התרופות שלנו. (אלג'יריה, 3000 מ"ר, מחלקה D)