חדר נקי מזון משמש בעיקר במשקאות, חלב, גבינות, פטריות וכו'. יש לו בעיקר חדר החלפה, מקלחת אוויר, מנעול אוויר ואזור ייצור נקי. חלקיקים מיקרוביאליים קיימים בכל מקום באוויר שגורמים בקלות למזון להתקלקל. חדר נקי סטרילי יכול לאחסן מזון בטמפרטורה נמוכה ולעקר מזון בטמפרטורה גבוהה על ידי הרג מיקרואורגניזם על מנת לשמור על תזונת המזון והטעם.
קח לדוגמא את אחד מחדרי האוכל הנקיים שלנו. (בנגלדש, 3000 מ"ר, ISO 8)